Christian Altenburger studierte an der Musikuniversität seiner Heimatstadt Wien und bei Dorothy DeLay an der Juilliard School New York. Mit 19 Jahren debütierte er als Solist im Wiener Musikverein. Rasch folgten Engagements bei internationalen Spitzenorchestern unter Dirigenten wie Claudio Abbado, Christoph von Dohnányi, Bernard Haitink, James Levine, Lorin Maazel, Zubin Mehta, Wolfgang Sawallisch, und Franz Welser-Möst. Als Kammermusiker konzertiert Christian Altenburger nicht nur leidenschaftlich gerne mit Kollegen und Freunden wie Silke Avenhaus, Patrick Demenga, Ralf Gothoni, Heinz Holliger, Reinhard Latzko, Michel Lethiec, Arto Noras, Jasmina Stancul und Melvyn Tan, sondern engagiert sich auch bei der Planung profilierter Programme. Von 1999–2005 fungierte er gemeinsam mit Julia Stemberger als künstlerischer Leiter des Festivals Mondseetage. Von 2003 bis 2019 war er für die künstlerische Leitung des Kammermusikfestivals Schwäbischer Frühling verantwortlich, und seit 2006 ist er künstlerischer Leiter des Festivals LOISIARTE. Nach langjähriger Professur an der Musikhochschule Hannover wurde Christian Altenburger 2001 als Professor an die Musikuniversität Wien berufen.